More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1365 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  52.28 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  50 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  49.24 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  48.68 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  48.17 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  46.23 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  44.85 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  46.6 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  48.19 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  46.63 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  46.35 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  46.11 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  45.23 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  46.63 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  45.96 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.4 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  42.29 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  45.08 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  47 
 
 		 205 aa  177  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  43.94 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3799  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19850  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  44.67 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44610  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 189 aa  174  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  41.75 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3585  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5126  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00768296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  44.39 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  43.68 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1533  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1849  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41197  normal  0.133584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6254  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0609451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1825  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.44 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  44 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>