More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1153 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  75.37 
 
 		 205 aa  278  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  56.19 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  53.85 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  50.78 
 
 		 198 aa  200  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  51.81 
 
 		 198 aa  198  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  54.01 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  50 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  50 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  51.31 
 
 		 199 aa  191  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  55.85 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  53.57 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  51.27 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  51.26 
 
 		 199 aa  188  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  51.03 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  48.47 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  51.87 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 203 aa  185  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  50.51 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  46.81 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  51.87 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  51.87 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  51.06 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  51.03 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  46.67 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  50.8 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  50.52 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  48.98 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  49.73 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  50 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  52.06 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  45.92 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  52.08 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  52.58 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  52.06 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  49.2 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  49.73 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  53.19 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  46.97 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  50 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1326  recombination protein RecR  47.98 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.787155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  45.13 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  50.79 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  51.04 
 
 		 197 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  47.94 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 211 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  48.45 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  46.67 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  50 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  46.84 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  48.66 
 
 		 189 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0953  recombination protein RecR  47.45 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  47.37 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1448  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  normal  0.0921659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1849  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41197  normal  0.133584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5126  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00768296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6254  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0609451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1825  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  46.84 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  44.55 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1736  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.0799588 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  42.21 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2221  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2359  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0253642  normal  0.0767451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>