More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0625 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  62.44 
 
 		 205 aa  268  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  63.37 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  57.79 
 
 		 206 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  58.29 
 
 		 205 aa  245  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  58.5 
 
 		 205 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  55.78 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  57.73 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  50.81 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  47.57 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  50.84 
 
 		 185 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  41.24 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  50.28 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.31 
 
 		 215 aa  188  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 200 aa  188  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  48.65 
 
 		 199 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  44.39 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  44.28 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  44.28 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  46.88 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  49.72 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  48.15 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 195 aa  184  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  42.79 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  44.55 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  40.84 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  48.11 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  43.07 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  41.27 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  40.31 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  40.53 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  39.47 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  38.62 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  41.79 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  42.86 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  40.84 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  39.29 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  38.62 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  43.39 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  46.37 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  42.21 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  42.7 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  40.2 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  39.29 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  37.11 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  38.1 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  38.66 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  38.66 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  38.66 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  48.33 
 
 		 182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0664  recombination protein RecR  43.78 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>