More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0362 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0362  recombination protein RecR  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07580  recombination protein RecR  73.66 
 
 		 205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  69.12 
 
 		 206 aa  304  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  61.08 
 
 		 203 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3028  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  61.5 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  60.29 
 
 		 204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  60.8 
 
 		 200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1255  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 207 aa  248  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  59.7 
 
 		 205 aa  247  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.78 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  49.16 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  45.41 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  44.04 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  43.92 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  46.93 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  46.93 
 
 		 182 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  43.81 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  47.25 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  43.28 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 197 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 197 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  42.35 
 
 		 199 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  40.4 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  43.39 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  44.32 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  40.93 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.17 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  41.27 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  41.12 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  39.59 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  38.86 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  40.53 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  41.21 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  40 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  40.3 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  40.53 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  41.29 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  42.08 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  39.18 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  39.79 
 
 		 203 aa  172  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  38.62 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  39.15 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  41.62 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  40 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0694  recombination protein RecR  41.49 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  38.62 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  41.27 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  38.1 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  39.9 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  40.8 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  40.31 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  38.1 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  37.37 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  40.1 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  39.68 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  37.37 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  42.79 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  38.95 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0664  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  38.1 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  37.7 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  39.06 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  38.78 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>