More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0328 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 213 aa  303  9.000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  70.56 
 
 		 198 aa  297  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  68.34 
 
 		 199 aa  295  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1409  recombination protein RecR  66.17 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.468928  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  64.47 
 
 		 198 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  64.47 
 
 		 198 aa  280  8.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  65.33 
 
 		 198 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  65.33 
 
 		 198 aa  272  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  65.33 
 
 		 198 aa  272  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  61.31 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  59.8 
 
 		 198 aa  260  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  59.8 
 
 		 198 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  55.84 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  56 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  57 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  55.5 
 
 		 199 aa  235  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  52.5 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  53.5 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  50.5 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  54.31 
 
 		 199 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  50 
 
 		 200 aa  218  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  50.77 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  50.77 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  51.01 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  49.75 
 
 		 198 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  47.5 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  50 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  51.55 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  49.24 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  50.5 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  51.55 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  48.5 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  48.97 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  49.21 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 198 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  46 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  46.5 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  47.24 
 
 		 222 aa  198  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  50 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  46.23 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  48.22 
 
 		 204 aa  197  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  45.05 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  48.4 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  48.4 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  47.52 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  48.4 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  46.5 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4329  recombination protein RecR  47.5 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.63547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  45.27 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  44 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  44.67 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  45 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000136854  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  44 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  46.39 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  46.39 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  48.66 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  43.5 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  45.36 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  43 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 203 aa  184  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  43.16 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  47.06 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  47.06 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>