More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1839 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  75 
 
 		 199 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  73.87 
 
 		 201 aa  292  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  72.36 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  72.36 
 
 		 201 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  73.2 
 
 		 200 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  71.86 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  284  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  71.72 
 
 		 200 aa  284  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  73.13 
 
 		 201 aa  284  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  73.13 
 
 		 201 aa  284  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  68.66 
 
 		 201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  66.33 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 232 aa  278  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  70.05 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  277  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  70.65 
 
 		 201 aa  277  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  66.33 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  68.34 
 
 		 201 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  64.18 
 
 		 201 aa  273  8e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 201 aa  271  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  67.16 
 
 		 201 aa  268  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  66.67 
 
 		 201 aa  257  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  66.15 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  63.18 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 200 aa  239  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 199 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 199 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  227  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  62.63 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  58.42 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  56.7 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  58.25 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  50 
 
 		 195 aa  218  5e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 195 aa  216  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  58.08 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  58.55 
 
 		 199 aa  215  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  59.28 
 
 		 197 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  44.62 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  43.59 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  44.33 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  42.56 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  45.13 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  42.19 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  46.37 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  43.37 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  45.03 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  41.03 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  37.95 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  44.97 
 
 		 189 aa  165  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  44.51 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 197 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  40 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  46.6 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  43.08 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>