More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4750 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  93.03 
 
 		 201 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  85.07 
 
 		 201 aa  345  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  83.08 
 
 		 201 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  83.08 
 
 		 201 aa  341  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  83.08 
 
 		 201 aa  341  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  74.24 
 
 		 199 aa  301  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  73.13 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  72.14 
 
 		 201 aa  299  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  72.64 
 
 		 201 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 201 aa  294  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  71.14 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  71.21 
 
 		 200 aa  291  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 201 aa  291  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  70.15 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  71.43 
 
 		 200 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  69.65 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  68.16 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  66.17 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  67.68 
 
 		 199 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  65.17 
 
 		 201 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  67.34 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  63.68 
 
 		 201 aa  275  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  73.13 
 
 		 201 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  66.14 
 
 		 201 aa  261  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  64.32 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  59.79 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  60.53 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  61.03 
 
 		 200 aa  238  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 199 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 199 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  60.62 
 
 		 199 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  59.28 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  59.47 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  58.55 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  58.7 
 
 		 196 aa  208  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  57.44 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  50 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.79 
 
 		 195 aa  198  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  55.15 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  46.32 
 
 		 195 aa  196  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  46.11 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  48.15 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  43.94 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  43.98 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 195 aa  164  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  45.99 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 200 aa  160  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.12 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  42.05 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  44.79 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  42.27 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  44.44 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  43.01 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  38.54 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  41.4 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  41.8 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  44.09 
 
 		 189 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  39.15 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  41.97 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  39.25 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  44.69 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  40.91 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>