More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1180 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  64.4 
 
 
195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  65.45 
 
 
195 aa  268  4e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  50 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  46.91 
 
 
198 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  48.95 
 
 
198 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  48.44 
 
 
201 aa  215  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  46.35 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  46.35 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  45.83 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  46.35 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  48.68 
 
 
201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  44.79 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  47.89 
 
 
198 aa  211  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  46.35 
 
 
201 aa  210  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  48.69 
 
 
197 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  48.15 
 
 
201 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  44.79 
 
 
201 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  49.48 
 
 
196 aa  209  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  44.79 
 
 
201 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  48.15 
 
 
232 aa  207  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  46.35 
 
 
201 aa  207  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  46.35 
 
 
199 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  48.15 
 
 
201 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  48.15 
 
 
201 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  44.79 
 
 
201 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  47.62 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  44.79 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  44.56 
 
 
201 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  46.07 
 
 
201 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  46.11 
 
 
201 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  43.52 
 
 
201 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  43.52 
 
 
199 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  43.01 
 
 
201 aa  191  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  43.01 
 
 
201 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  43.46 
 
 
200 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  44.04 
 
 
199 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  44.04 
 
 
199 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  44.27 
 
 
199 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  44.33 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  44.56 
 
 
197 aa  187  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  44.74 
 
 
201 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  42.49 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.12 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  43.46 
 
 
199 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  43.46 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  41.33 
 
 
196 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.01 
 
 
199 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  41.05 
 
 
202 aa  176  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  42.11 
 
 
199 aa  175  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  47.37 
 
 
199 aa  174  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  43.78 
 
 
196 aa  174  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  42.05 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  40.93 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  40.21 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  41.36 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  41.05 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  42.41 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  39.79 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  42.19 
 
 
199 aa  171  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  40.72 
 
 
199 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  40.62 
 
 
198 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  39.58 
 
 
194 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  40.53 
 
 
199 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  41.88 
 
 
198 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  41.88 
 
 
198 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  42.41 
 
 
200 aa  169  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  43.46 
 
 
197 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  42.19 
 
 
201 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  40.31 
 
 
198 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  39.47 
 
 
199 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  40.31 
 
 
198 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  40.31 
 
 
198 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  38.14 
 
 
199 aa  168  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  40 
 
 
199 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  39.47 
 
 
199 aa  167  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  38.22 
 
 
198 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  37.89 
 
 
197 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  43.59 
 
 
201 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  39.69 
 
 
199 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  39.79 
 
 
198 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.36 
 
 
198 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  43.59 
 
 
201 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  38.42 
 
 
199 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  38.14 
 
 
199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  38.42 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  42.63 
 
 
197 aa  165  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  42.41 
 
 
199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  40.93 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>