More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3878 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  75.38 
 
 		 199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  75.38 
 
 		 199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  73.87 
 
 		 199 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  74.37 
 
 		 199 aa  298  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  73.23 
 
 		 199 aa  298  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  73.37 
 
 		 199 aa  289  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  62.76 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  60.61 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  57.79 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  61.22 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 201 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  58.67 
 
 		 200 aa  231  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 201 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  57.51 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  56.63 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  61.03 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  59.59 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  59.59 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 201 aa  224  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 200 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  59.07 
 
 		 201 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  55.96 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  57.14 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  58.55 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  56.48 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  55.9 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  56.48 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  58.55 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  57.07 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  44.74 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  43.46 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  53.3 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  43.75 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  43.75 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  43.23 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  42.11 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  41.75 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  42.71 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  41.05 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  42.93 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  40.5 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  40.84 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  41.92 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  44.22 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  44.79 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  41.05 
 
 		 204 aa  160  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  42.13 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  40.47 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0952  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.051321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0547  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  40 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0591  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0537  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0531  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0531  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00423  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3138  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00115483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3144  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000102552  normal  0.0467861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0515  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0104504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  39.58 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0404  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00880245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0510  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00333921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0549  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0169902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0563  recombination protein RecR  43.22 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  39.7 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  40.5 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  38.69 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1856  recombination protein RecR  39.59 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>