More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3471 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  100 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  63.68 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  63.16 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  65.31 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7344  recombination protein RecR  62.63 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  62.18 
 
 		 200 aa  244  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  60.82 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  61.66 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 200 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  63.68 
 
 		 201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  62.11 
 
 		 201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  65.1 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  65.1 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3878  recombination protein RecR  62.76 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.114118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  64.58 
 
 		 199 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4043  recombination protein RecR  61.42 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  62.11 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  58.88 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  62.63 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  62.63 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  62.63 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3647  recombination protein RecR  63.73 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664913  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1920  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.700264  normal  0.039212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1638  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0212504  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  62.11 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  60.41 
 
 		 198 aa  229  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  61.58 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  57.37 
 
 		 201 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4750  recombination protein RecR  59.47 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  60.91 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3145  recombination protein RecR  60.53 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216017  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  58.42 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0648  recombination protein RecR  60.1 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0126117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0164  recombination protein RecR  58.03 
 
 		 199 aa  224  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1594  recombination protein RecR  59.47 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  60.22 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4241  recombination protein RecR  57.89 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  61.83 
 
 		 196 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  62.63 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0843  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  48.69 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0245  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 195 aa  208  5e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0727285  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  47.67 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  60.2 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  47.4 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  47.69 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  47.69 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  47.69 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  48.72 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  48.96 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  46.19 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  51.05 
 
 		 199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  47.69 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1921  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1593  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.198008  normal  0.0655144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  45.83 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.26 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  45.69 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  45.21 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2332  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1795  recombination protein RecR  48.19 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000406464  unclonable  0.00000000671172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0509  recombination protein RecR  48.45 
 
 		 196 aa  168  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  42.63 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0808  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000914779  hitchhiker  0.00000103011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2233  recombination protein RecR  48.19 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000324315  hitchhiker  0.000184375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  44.15 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  45 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  45.13 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  47.06 
 
 		 189 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  48.42 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  46.67 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  41.58 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2348  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1509  recombination protein RecR  47.89 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  47.06 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  46.19 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  46.35 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>