More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2777 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2777  recombination protein RecR  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  50 
 
 		 201 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  48.96 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  46.63 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  50.53 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  49.47 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  46.11 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4091  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0156  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2911  recombination protein RecR  53.4 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0675697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  47.4 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3435  recombination protein RecR  50.28 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  47.92 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  48.17 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  47.12 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  48.47 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  44.39 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  48.44 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  45.08 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40.21 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  46.07 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  42.27 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  45.31 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  46.11 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  45.64 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  42.41 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  44.56 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0367  recombination protein RecR  44.06 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  47.09 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  47.64 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  46.56 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  45.08 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  39.06 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  46.57 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  46.88 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  45.83 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  45.55 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  44.27 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  45.6 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  42.27 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  42.27 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  41.67 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  41.8 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  40.41 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  45.31 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0519  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217217  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  45.18 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  46.11 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  44.95 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  44.1 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>