More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2435 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 375 aa  739    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  66.67 
 
 		 360 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.51 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.71 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.71 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.71 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.38 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.4 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.43 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  58.81 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  58.21 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.15 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  55.86 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.68 
 
 		 357 aa  348  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  57.34 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  56.29 
 
 		 366 aa  332  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.09 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  56.11 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  54.17 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  54.9 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49 
 
 		 363 aa  318  7.999999999999999e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.5 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.48 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.47 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  49.85 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.85 
 
 		 378 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.06 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.16 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  50.14 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.49 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.54 
 
 		 363 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.24 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.77 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.54 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.15 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.22 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.32 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  51.12 
 
 		 354 aa  272  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.55 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  47.19 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.84 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  52.99 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.73 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.32 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.63 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 		 393 aa  268  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.24 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.2 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.79 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.5 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.6 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.61 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.15 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.5 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.5 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.34 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  42.62 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.23 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.23 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.57 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.23 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.5 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.19 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.96 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  48.61 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  39.94 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.98 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 342 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.07 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  45.32 
 
 		 342 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  45.09 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.33 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.94 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 		 339 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  42.58 
 
 		 367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  44.6 
 
 		 348 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  45.13 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  43.33 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 340 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  45.11 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  45.11 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>