More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2166 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 348 aa  700    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  72.09 
 
 		 344 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  71.43 
 
 		 339 aa  482  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.05 
 
 		 343 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.08 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  60.17 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.34 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.24 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.84 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.33 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.33 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.33 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.69 
 
 		 361 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  46.53 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.55 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  49.56 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  46.27 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.27 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  45.01 
 
 		 375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 		 336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.67 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.28 
 
 		 349 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  48.96 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.06 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 		 361 aa  301  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  48.66 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  47.65 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.01 
 
 		 377 aa  298  9e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 337 aa  298  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.06 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.55 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.76 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.48 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  48.8 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.4 
 
 		 336 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 		 344 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.65 
 
 		 377 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.37 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.14 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.63 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  44.57 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.03 
 
 		 359 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 351 aa  291  9e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.47 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.35 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.35 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.92 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.54 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  43.75 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 		 355 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 		 357 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>