More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7230 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 340 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.36 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.39 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.29 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  60.87 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  59.52 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.77 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.24 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  49.71 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.26 
 
 		 363 aa  325  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  52.98 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  50.57 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.72 
 
 		 376 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.55 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 377 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.76 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.94 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.63 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.06 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.28 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 349 aa  288  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 365 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.67 
 
 		 352 aa  287  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.64 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.51 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.65 
 
 		 377 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  44.44 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.32 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 353 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.2 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  44.7 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.47 
 
 		 353 aa  279  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.83 
 
 		 358 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  43.44 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  45.75 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  43.68 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 347 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.9 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  45.38 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  45.29 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  44.71 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  45.38 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.77 
 
 		 350 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 341 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.86 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 364 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  43.23 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.31 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  43.23 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>