More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1896 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
377 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  98.67 
 
 
377 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.31 
 
 
377 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.6 
 
 
376 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  60.99 
 
 
377 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 
378 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  56.13 
 
 
375 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.06 
 
 
378 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  45.82 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 
392 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.52 
 
 
392 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49.7 
 
 
363 aa  315  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.26 
 
 
393 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.89 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.48 
 
 
385 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.79 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  48.4 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  45.76 
 
 
361 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.54 
 
 
361 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.66 
 
 
356 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.5 
 
 
342 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 
344 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.25 
 
 
340 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.93 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.04 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.94 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.59 
 
 
349 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
389 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.27 
 
 
356 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.27 
 
 
356 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.27 
 
 
356 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.6 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  44.44 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.98 
 
 
361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 
353 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 
353 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.42 
 
 
357 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 
363 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  44.38 
 
 
363 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  42.05 
 
 
357 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 
367 aa  265  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.1 
 
 
354 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  45.37 
 
 
352 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.89 
 
 
360 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.57 
 
 
350 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  42.94 
 
 
361 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  43.88 
 
 
370 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.2 
 
 
377 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  42.99 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  46.84 
 
 
375 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.14 
 
 
355 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.21 
 
 
337 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.25 
 
 
356 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  42.99 
 
 
348 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  46.05 
 
 
355 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 
336 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.67 
 
 
336 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  42.66 
 
 
335 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.44 
 
 
345 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 
345 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  41.08 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.47 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  40.83 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  41 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  43.71 
 
 
396 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 
349 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.93 
 
 
364 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  44.97 
 
 
336 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.58 
 
 
357 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.34 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  42.35 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  40.27 
 
 
344 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  42.06 
 
 
335 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 
344 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  41.5 
 
 
356 aa  242  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  42.41 
 
 
361 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.52 
 
 
353 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 
369 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.96 
 
 
339 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.37 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
340 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 
340 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.36 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 
335 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 
352 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 
362 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.45 
 
 
354 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.49 
 
 
363 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.96 
 
 
339 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.09 
 
 
336 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>