More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5166 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  87.92 
 
 
356 aa  641    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  719    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.65 
 
 
360 aa  347  1e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.81 
 
 
350 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.4 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.34 
 
 
367 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.54 
 
 
348 aa  289  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  42.7 
 
 
356 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.37 
 
 
339 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  45.81 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.93 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  42.82 
 
 
363 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  45.78 
 
 
364 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  41.03 
 
 
355 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 
343 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
344 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 
357 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.8 
 
 
376 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.21 
 
 
352 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  46.03 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.06 
 
 
349 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.96 
 
 
352 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.74 
 
 
356 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.74 
 
 
356 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 
361 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.96 
 
 
352 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.74 
 
 
356 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  41.18 
 
 
377 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 
352 aa  269  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.53 
 
 
367 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.2 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.28 
 
 
364 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.96 
 
 
352 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.9 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  41.78 
 
 
360 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 
361 aa  265  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  41.84 
 
 
336 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.73 
 
 
364 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
337 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  42.55 
 
 
375 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 
377 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.83 
 
 
364 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.78 
 
 
346 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.83 
 
 
357 aa  263  4e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.18 
 
 
355 aa  263  4.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.13 
 
 
349 aa  262  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.88 
 
 
340 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
349 aa  262  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.2 
 
 
348 aa  262  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.57 
 
 
357 aa  262  8e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  43.09 
 
 
384 aa  261  8.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.26 
 
 
336 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.26 
 
 
336 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.26 
 
 
336 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 
352 aa  260  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.17 
 
 
339 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 
336 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 
357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.94 
 
 
336 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 
347 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  43.11 
 
 
336 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.42 
 
 
336 aa  258  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  39.04 
 
 
355 aa  258  9e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  44.51 
 
 
374 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  45 
 
 
396 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.63 
 
 
356 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.02 
 
 
377 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 
336 aa  258  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 
336 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 
377 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.2 
 
 
351 aa  256  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 
333 aa  255  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.88 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  41.02 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  44.54 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.91 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  41.09 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.47 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.56 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  40.35 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 
336 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  43.44 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 
336 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>