More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0179 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  708    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
355 aa  293  4e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 
357 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 
348 aa  286  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.01 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 
367 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 
348 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 
364 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 
354 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 
364 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 
364 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.45 
 
 
357 aa  271  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 
364 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 
354 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 
352 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 
354 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 
364 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.48 
 
 
350 aa  268  8e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.37 
 
 
352 aa  268  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.54 
 
 
356 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 
352 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 
356 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.34 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 
364 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  44.94 
 
 
360 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.43 
 
 
350 aa  263  4e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 
358 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  42.66 
 
 
361 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  42.53 
 
 
374 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 
363 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.64 
 
 
358 aa  255  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  42.54 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  41.67 
 
 
367 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  40.35 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 
362 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 
362 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 
362 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.83 
 
 
358 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.31 
 
 
361 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  41.9 
 
 
356 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.52 
 
 
358 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 
348 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 
364 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 
364 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  43.91 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.88 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 
378 aa  242  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.05 
 
 
363 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  41.14 
 
 
357 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.36 
 
 
362 aa  239  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.69 
 
 
376 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.15 
 
 
339 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.17 
 
 
364 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.94 
 
 
377 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 
353 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.48 
 
 
331 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 
353 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.22 
 
 
354 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  42.72 
 
 
361 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 
359 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.43 
 
 
356 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.86 
 
 
348 aa  235  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  41.61 
 
 
355 aa  235  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.62 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.64 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.6 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.25 
 
 
377 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.6 
 
 
351 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  38.9 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.18 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  41.07 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 
357 aa  232  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.25 
 
 
377 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 
352 aa  232  9e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  42.04 
 
 
361 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.26 
 
 
364 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.26 
 
 
364 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  41.03 
 
 
349 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.08 
 
 
360 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.54 
 
 
364 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 
335 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  43.17 
 
 
375 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  41.8 
 
 
363 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
359 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.82 
 
 
352 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.12 
 
 
359 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.82 
 
 
352 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  40.82 
 
 
375 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.82 
 
 
352 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 
343 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  41.47 
 
 
340 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 
351 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.97 
 
 
352 aa  227  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>