More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0825 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 375 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  61.25 
 
 		 377 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.52 
 
 		 377 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.43 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.1 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.68 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.13 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.03 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  53.91 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  54.26 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  49.04 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.98 
 
 		 340 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.72 
 
 		 392 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.34 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.44 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.5 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.01 
 
 		 348 aa  306  6e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.55 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.5 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.01 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.13 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  44.23 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.48 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.48 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.48 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.11 
 
 		 343 aa  295  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.33 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.5 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.5 
 
 		 344 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.25 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.38 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.51 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.55 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  43.78 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.22 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.22 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  51.76 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  49.68 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  49.85 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.88 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  50 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.49 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.74 
 
 		 345 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.2 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  48.61 
 
 		 370 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  43.47 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  50.85 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 350 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  47.25 
 
 		 335 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  47.08 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  43.09 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.34 
 
 		 357 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.01 
 
 		 377 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  45.12 
 
 		 335 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.75 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.38 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.38 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.55 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.19 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.98 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.38 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.38 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.38 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.37 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.37 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.37 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.03 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  44.79 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 344 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  44.44 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  44.44 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>