More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3190 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 343 aa  698    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  66.47 
 
 		 349 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.91 
 
 		 361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.05 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.54 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  61.7 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.29 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.4 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  49.85 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.59 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  49.86 
 
 		 377 aa  312  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  49.42 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  47.51 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.88 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.13 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.28 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.4 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  50.29 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 339 aa  295  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.86 
 
 		 340 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  51.11 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  47.98 
 
 		 360 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  48.22 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.06 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  48.7 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.74 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 344 aa  286  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  46.45 
 
 		 348 aa  285  5.999999999999999e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.54 
 
 		 364 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.27 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 362 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 		 356 aa  281  9e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.8 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  45.56 
 
 		 352 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.44 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  44.25 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  46.43 
 
 		 335 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 351 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.33 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.47 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  43.3 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.09 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.4 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  46.13 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 353 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>