More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0627 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  720    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  50 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.68 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.35 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  45.41 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  45.78 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.93 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.3 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.51 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.46 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.57 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.73 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  43.7 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.63 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  46.74 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.44 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.44 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 357 aa  262  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  42.16 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.14 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.76 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.14 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.23 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.08 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  44.11 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.87 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.87 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  43.19 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  42.94 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  44.62 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.13 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.72 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.65 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.37 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 356 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.31 
 
 		 353 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.84 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.68 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.88 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  39.31 
 
 		 377 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  45.63 
 
 		 361 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.6 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.47 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.93 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.6 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.46 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.31 
 
 		 336 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.78 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.78 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.18 
 
 		 377 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  39.45 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.04 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.19 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.54 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  44.51 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  45.71 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  43.97 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  43.97 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.73 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.38 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.81 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  42.94 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.54 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 358 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  38.4 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.08 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  39.83 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.67 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.29 
 
 		 358 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 		 396 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  39.94 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.67 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.67 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.09 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  44.7 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.57 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.43 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>