More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2007 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 378 aa  770    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.4 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  60.74 
 
 		 377 aa  474  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  56.1 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.99 
 
 		 377 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.07 
 
 		 378 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.8 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 392 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  49.44 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.58 
 
 		 356 aa  318  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.33 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 		 389 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.01 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  46.48 
 
 		 360 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 342 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 385 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.3 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  45.03 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 389 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.03 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.93 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 343 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.16 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 344 aa  299  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.13 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.63 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.18 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.13 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.69 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  43.5 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  43.5 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.93 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.69 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.01 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  44.94 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.34 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  43.14 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  40.74 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  44.51 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.22 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.65 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.61 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.21 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.78 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.33 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  41.9 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.93 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  41.91 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  39.4 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.38 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.66 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.51 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  39.73 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.33 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.33 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.96 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.95 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.98 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.8 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.69 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  43.45 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  41.6 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.21 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.34 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  41.58 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  42.25 
 
 		 361 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.74 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.35 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.54 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  40.68 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.71 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 		 342 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  43.12 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  42.24 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.69 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 		 343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.38 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.8 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.46 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>