More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2406 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 376 aa  732    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.16 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.76 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.7 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.28 
 
 		 375 aa  394  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  61.58 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  63.07 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  63.61 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  59.78 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  61.62 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  56.57 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.76 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.76 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.76 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  60.05 
 
 		 355 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.95 
 
 		 353 aa  352  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  57.79 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  57.99 
 
 		 370 aa  338  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.49 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.06 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  54.55 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  51.12 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.12 
 
 		 363 aa  299  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  58.07 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.67 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  52.79 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.11 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.44 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.12 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.55 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 363 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  43.35 
 
 		 377 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  42.71 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  47.18 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  51.34 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.12 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.72 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.29 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.77 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.25 
 
 		 376 aa  268  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.53 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.58 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  43.43 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.27 
 
 		 364 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  52.35 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.43 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.12 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.22 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.86 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.86 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.86 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.78 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.47 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  44.72 
 
 		 384 aa  259  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.58 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  43.67 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.31 
 
 		 342 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.18 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.22 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.22 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.17 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.68 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.1 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.17 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 		 335 aa  255  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.01 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.4 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  42.94 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 344 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.16 
 
 		 336 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.29 
 
 		 339 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.45 
 
 		 336 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.29 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.12 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.64 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  40.4 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>