More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9004 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  100 
 
 
355 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  76.27 
 
 
396 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  66.2 
 
 
361 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.98 
 
 
377 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  60 
 
 
389 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.94 
 
 
357 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  57.26 
 
 
360 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.31 
 
 
356 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.31 
 
 
356 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.31 
 
 
356 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.15 
 
 
356 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  60.12 
 
 
366 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.62 
 
 
353 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  60.6 
 
 
376 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  57.63 
 
 
355 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.02 
 
 
357 aa  346  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.73 
 
 
353 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.74 
 
 
375 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  56.39 
 
 
370 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  56.03 
 
 
375 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  52.01 
 
 
348 aa  315  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  48.45 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  47.98 
 
 
363 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  54.78 
 
 
354 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  55.94 
 
 
342 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  53.11 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.12 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.7 
 
 
339 aa  299  4e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.09 
 
 
361 aa  295  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 
348 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.29 
 
 
363 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.87 
 
 
385 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.13 
 
 
385 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.69 
 
 
356 aa  281  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.22 
 
 
349 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  52.59 
 
 
354 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.82 
 
 
352 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 
378 aa  278  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.56 
 
 
393 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 
364 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 
364 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
340 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.54 
 
 
378 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.26 
 
 
348 aa  275  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.04 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  45.66 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 
356 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  48.6 
 
 
374 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  44.92 
 
 
367 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
393 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 
356 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  43.13 
 
 
375 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 
343 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  41.62 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 
352 aa  270  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.59 
 
 
376 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
392 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 
360 aa  269  7e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  268  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 
358 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.29 
 
 
364 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  52.79 
 
 
344 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
344 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 
336 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 
358 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.11 
 
 
362 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.72 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.52 
 
 
336 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 
362 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
339 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.69 
 
 
358 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.46 
 
 
336 aa  266  5.999999999999999e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 
358 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.36 
 
 
389 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.19 
 
 
347 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.48 
 
 
359 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.19 
 
 
347 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.21 
 
 
377 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
339 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
339 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
339 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.24 
 
 
336 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.72 
 
 
339 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 
392 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.01 
 
 
340 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.11 
 
 
336 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.24 
 
 
336 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  44.75 
 
 
344 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
339 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
339 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.31 
 
 
341 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.47 
 
 
336 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 
342 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.12 
 
 
339 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 
362 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>