More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2490 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 352 aa  706    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  54.86 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  53.33 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.44 
 
 		 356 aa  315  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 342 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.84 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  47.74 
 
 		 361 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  49.27 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  44.06 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 339 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.96 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 348 aa  288  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.85 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.71 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 343 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.84 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.14 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 		 335 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.9 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  51.03 
 
 		 375 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.37 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.19 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  49.12 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.7 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 339 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  51.04 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  50.3 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  50.3 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  45.56 
 
 		 377 aa  275  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  48.18 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.17 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.87 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  43.99 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 		 337 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  44.54 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  44.7 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.45 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  45.61 
 
 		 343 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.01 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  44.02 
 
 		 335 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  44.31 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  44.07 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.24 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  46.93 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.62 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.62 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 377 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  43.8 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  48.69 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>