More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5856 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.47 
 
 		 343 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.75 
 
 		 361 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.58 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.17 
 
 		 348 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  60.12 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.78 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.87 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  52.72 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  51.29 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.72 
 
 		 361 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 342 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  49.86 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.45 
 
 		 376 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  49.04 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.16 
 
 		 356 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.73 
 
 		 377 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 378 aa  308  9e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  49.57 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  53.35 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  47.69 
 
 		 360 aa  301  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.34 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.14 
 
 		 357 aa  298  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.74 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  48.66 
 
 		 352 aa  291  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.14 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.85 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.42 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.55 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.44 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  46.88 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  47.8 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  47.44 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  47.48 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.41 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.36 
 
 		 349 aa  282  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  48.99 
 
 		 377 aa  281  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.44 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.97 
 
 		 357 aa  281  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.54 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.42 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.42 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.42 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.59 
 
 		 377 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.46 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.59 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.42 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  47.25 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.83 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.95 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.48 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.16 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.69 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  44.83 
 
 		 342 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.77 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  48.04 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.63 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.01 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  45.16 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.63 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>