More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3487 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 353 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  86.97 
 
 		 353 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  79.83 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  79.83 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  79.83 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  74.5 
 
 		 357 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  64.97 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  65.5 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.71 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  59.65 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  60 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  59.25 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  57.18 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.86 
 
 		 356 aa  336  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  57.02 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.05 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  56.21 
 
 		 370 aa  322  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  55 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  47.31 
 
 		 377 aa  319  6e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.76 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.87 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  56.2 
 
 		 376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  48.16 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.27 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  47.65 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.93 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  49.69 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.87 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.45 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.61 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.31 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.77 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  50.57 
 
 		 348 aa  282  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.31 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  50.14 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.72 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 		 339 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  43.94 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 377 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.92 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.27 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.02 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.76 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  42.69 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 360 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.62 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.2 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.02 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  43.63 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.47 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.21 
 
 		 355 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  43.79 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  44.79 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  51.32 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.78 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.44 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  45.89 
 
 		 348 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  44.14 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.29 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.6 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  54.55 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.18 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.68 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.2 
 
 		 339 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  43.82 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.33 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.33 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.43 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  38.98 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  44.26 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  44.26 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.33 
 
 		 339 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.31 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.84 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  51.45 
 
 		 342 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.37 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.37 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.37 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>