More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02171 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  92.03 
 
 		 389 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  82.01 
 
 		 389 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  90.49 
 
 		 389 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 389 aa  780    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.45 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.48 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.46 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.46 
 
 		 385 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.76 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.56 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.42 
 
 		 377 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.93 
 
 		 378 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  44.69 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.61 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.89 
 
 		 377 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  43.02 
 
 		 363 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  43.73 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.05 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.24 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.17 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.76 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.76 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.76 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.7 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.46 
 
 		 344 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  39.57 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  40 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  43.77 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  40.71 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.67 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.27 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  41.36 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  42.39 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  38.85 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  36.41 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.01 
 
 		 342 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.79 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.49 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  40.74 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.55 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 345 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  40.45 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.08 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 339 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  39.22 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  38.7 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.77 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.32 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.97 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.88 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  42.82 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  44.33 
 
 		 335 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  36.32 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.08 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.72 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.81 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  43.93 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  39.79 
 
 		 370 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.44 
 
 		 344 aa  242  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  44.15 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.38 
 
 		 349 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.97 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.6 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.1 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  42.07 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.64 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  41.23 
 
 		 357 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.49 
 
 		 351 aa  239  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.27 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.14 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.33 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>