More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3039 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 353 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  86.97 
 
 		 353 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.27 
 
 		 356 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.27 
 
 		 356 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.27 
 
 		 356 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  73.94 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  64.12 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  64.33 
 
 		 375 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.57 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  57.94 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  56.77 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  58.15 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.46 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  57.34 
 
 		 370 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  51.67 
 
 		 377 aa  323  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.59 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  55.87 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  56.4 
 
 		 366 aa  319  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  54.71 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.02 
 
 		 357 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  53 
 
 		 377 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.74 
 
 		 355 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  55.06 
 
 		 376 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  46.81 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.35 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.55 
 
 		 375 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.84 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.47 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.62 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  50.42 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.61 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.79 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.6 
 
 		 343 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.38 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  51.32 
 
 		 367 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 		 377 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.07 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.68 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.4 
 
 		 342 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.28 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.64 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.55 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.24 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.96 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.99 
 
 		 348 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.24 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  42.57 
 
 		 336 aa  261  8.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.15 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  52.31 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.95 
 
 		 348 aa  259  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  38.98 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.66 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  43.94 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.21 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  41.36 
 
 		 356 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.87 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.87 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.67 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.61 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.27 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.41 
 
 		 389 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.59 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.46 
 
 		 362 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  44.82 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  42.52 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  44.18 
 
 		 342 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  42.19 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.33 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  44.41 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  50.58 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  44.41 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.73 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  51.34 
 
 		 344 aa  242  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 336 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>