More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0500 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 361 aa  704    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.33 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.06 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.41 
 
 		 361 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  50.57 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.66 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  52.63 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.3 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  51.4 
 
 		 348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  50 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.41 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  50.98 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.75 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.4 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.87 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  48.17 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.75 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 344 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.33 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.79 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.35 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.89 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.63 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  44.85 
 
 		 377 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.44 
 
 		 362 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.01 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.27 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.56 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.8 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.11 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  49.16 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.89 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.28 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.28 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  50.68 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.32 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.51 
 
 		 363 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  51.12 
 
 		 355 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.51 
 
 		 363 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.79 
 
 		 363 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.75 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.33 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.33 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.43 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.62 
 
 		 352 aa  278  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.27 
 
 		 340 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 352 aa  277  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  48.87 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.36 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.89 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.98 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.31 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.98 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  48.76 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.23 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.29 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  42.04 
 
 		 456 aa  268  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.03 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  46.49 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  48.23 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.52 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.4 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.03 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.46 
 
 		 352 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 		 345 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 339 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  46.49 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  44.26 
 
 		 356 aa  265  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 364 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 365 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  47.8 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.22 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  45 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.86 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.14 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>