More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0786 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
352 aa  706    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.63 
 
 
357 aa  477  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.54 
 
 
357 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.36 
 
 
352 aa  435  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  58 
 
 
351 aa  431  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.24 
 
 
352 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.95 
 
 
352 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.95 
 
 
352 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  56 
 
 
355 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.85 
 
 
352 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.63 
 
 
356 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.36 
 
 
361 aa  275  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.21 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  40.91 
 
 
356 aa  269  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  40.91 
 
 
356 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 
360 aa  265  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.01 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.01 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.01 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  41.45 
 
 
349 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  38.4 
 
 
357 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  39.43 
 
 
363 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.09 
 
 
357 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  37.54 
 
 
360 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.14 
 
 
361 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  38.35 
 
 
361 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.98 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  37.08 
 
 
367 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.45 
 
 
340 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.01 
 
 
357 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.81 
 
 
363 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 
342 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.57 
 
 
377 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
343 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.72 
 
 
367 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  37.25 
 
 
355 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  37.74 
 
 
363 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  37.74 
 
 
363 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
344 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.68 
 
 
353 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
336 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.89 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.46 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.47 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  39.18 
 
 
384 aa  242  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 
355 aa  242  7.999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.24 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.24 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  37.61 
 
 
361 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.24 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.59 
 
 
356 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 
336 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.46 
 
 
364 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  37.18 
 
 
366 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
336 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
336 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
336 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
336 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
336 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
336 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.72 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.19 
 
 
347 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  40.42 
 
 
348 aa  238  8e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.55 
 
 
355 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  39.88 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.64 
 
 
336 aa  235  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.69 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.55 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.26 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.05 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  35.78 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.33 
 
 
378 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  38.64 
 
 
374 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.01 
 
 
357 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  40.83 
 
 
336 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  37.09 
 
 
370 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.97 
 
 
354 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.24 
 
 
340 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  37.64 
 
 
348 aa  232  9e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 
356 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.24 
 
 
376 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.26 
 
 
385 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.05 
 
 
341 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.12 
 
 
336 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.68 
 
 
352 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.52 
 
 
339 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.97 
 
 
354 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.96 
 
 
349 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  35.01 
 
 
389 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  40.12 
 
 
336 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  36.02 
 
 
355 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>