More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0581 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 351 aa  711    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.94 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  58 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.51 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.83 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  55.56 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.84 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.84 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.56 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 352 aa  354  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  42.78 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.52 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  36.52 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.99 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  37.29 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  40.36 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  35.2 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  38.33 
 
 		 357 aa  251  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.42 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  36.77 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.75 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  36.77 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.33 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.33 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.48 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.53 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.84 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.84 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.84 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  38.27 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  37.18 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.36 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  36.44 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  36.44 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.18 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.16 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.08 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.08 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 364 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  35.88 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.31 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  38.28 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.78 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  35.61 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.84 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  38.82 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  35.57 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.61 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  34.11 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  34.67 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.57 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.58 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  39.6 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.63 
 
 		 348 aa  232  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.16 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.18 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.92 
 
 		 344 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.9 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.8 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.94 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.94 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.94 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  37.64 
 
 		 340 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  34.36 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.82 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.07 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.88 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.89 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  36.95 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.21 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  35.59 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.96 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.76 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.29 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  34.38 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.06 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.53 
 
 		 348 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.65 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.29 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.73 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  35.19 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.68 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>