More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1056 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  728    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.82 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.93 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.56 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.01 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  56 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.43 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.42 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.42 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.42 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  39.94 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  40.72 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  39.77 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.77 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.7 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.7 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.7 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  39.38 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.27 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  39.04 
 
 		 356 aa  258  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.98 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  40.56 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  39.89 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 		 378 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  41.79 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 		 363 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  39.14 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.96 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.17 
 
 		 364 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.27 
 
 		 357 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.03 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  37.17 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.95 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.98 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  39.06 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  39.06 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.12 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.77 
 
 		 378 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  34.83 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.17 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.82 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  43.85 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.06 
 
 		 358 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.09 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.21 
 
 		 392 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.73 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.78 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  35.75 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  37.36 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  39 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  40.76 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.51 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.25 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  39.35 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.92 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  39.89 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  38.53 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.27 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.06 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.46 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.06 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.07 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.88 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  39.71 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.71 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.46 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.73 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.13 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 389 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.06 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.78 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.79 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  40.69 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  39.53 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.17 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.16 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.87 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.25 
 
 		 364 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.46 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.28 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 339 aa  226  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  38.99 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.95 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.34 
 
 		 377 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.92 
 
 		 331 aa  225  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  37.67 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.27 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.11 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.82 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>