More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3807 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 374 aa  720    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.35 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.04 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.74 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.78 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.16 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.58 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.99 
 
 		 364 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.39 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  64.57 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.34 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.36 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.63 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.17 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.59 
 
 		 364 aa  358  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.59 
 
 		 364 aa  358  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.07 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  56.81 
 
 		 348 aa  346  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.35 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.4 
 
 		 363 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.03 
 
 		 362 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.08 
 
 		 362 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.21 
 
 		 356 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.58 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.42 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.72 
 
 		 352 aa  315  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.45 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  49.31 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.72 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.58 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 		 355 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.86 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.69 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.69 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.86 
 
 		 343 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.86 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.25 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.98 
 
 		 357 aa  278  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  45.1 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.87 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.19 
 
 		 355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  42.49 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.07 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.9 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  46.91 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.96 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.89 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 		 355 aa  266  5.999999999999999e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.25 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 357 aa  265  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.24 
 
 		 343 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.43 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.18 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.14 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.14 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.14 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.05 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.91 
 
 		 339 aa  262  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.11 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  45.2 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  42.23 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  48.21 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  48.21 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  44.51 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.28 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  42.53 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.96 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  46.09 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.75 
 
 		 335 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  43.2 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.62 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>