More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0586 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 363 aa  728    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.69 
 
 		 362 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.31 
 
 		 362 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  74.1 
 
 		 362 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.69 
 
 		 364 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.69 
 
 		 364 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.51 
 
 		 364 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.95 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.5 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  59.71 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.68 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.4 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.11 
 
 		 364 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.4 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.26 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.28 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.42 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.65 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.57 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  56.98 
 
 		 374 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.41 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.29 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 		 349 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 355 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.41 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.99 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  56.67 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.59 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.45 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.72 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.28 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.14 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.3 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.72 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 343 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  49.43 
 
 		 349 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.38 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.8 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.49 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.85 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.48 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.96 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.89 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.07 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.18 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  45.98 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.46 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.59 
 
 		 336 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.36 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.97 
 
 		 348 aa  282  7.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.54 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 		 336 aa  282  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.06 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.42 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.04 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.71 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.15 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.41 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.26 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  45.24 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 345 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.32 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 350 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.85 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.87 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.41 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  46.11 
 
 		 377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>