More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0680 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 356 aa  695    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.01 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.76 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.97 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  54.49 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.98 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.98 
 
 		 354 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.73 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.71 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.18 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.57 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.43 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.71 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.98 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.45 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.48 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.4 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.84 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.43 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 364 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 364 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 364 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  51.58 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.57 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  48 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.92 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.51 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.71 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.59 
 
 		 357 aa  289  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.13 
 
 		 364 aa  289  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  48.02 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  48 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.17 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.53 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  52.51 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.99 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.57 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.34 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  45.86 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  48.56 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.14 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.07 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  43.84 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.96 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.96 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.96 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  42.61 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.73 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  44.66 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 		 343 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.74 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.77 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 360 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.07 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.45 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 		 396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 340 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.5 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.6 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.41 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  41.07 
 
 		 377 aa  262  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.48 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.13 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  47.83 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.25 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.45 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  44.09 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  44.31 
 
 		 344 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.13 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.87 
 
 		 342 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.21 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.76 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  42.34 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.84 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.94 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  43.53 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.52 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.52 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>