More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2144 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 354 aa  725    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.84 
 
 		 354 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.84 
 
 		 354 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.89 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  39.44 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41.67 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.62 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.88 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.15 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.02 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  37.54 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  40.58 
 
 		 349 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.29 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  38.2 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  37.18 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.66 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  38.18 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.15 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.15 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.46 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.55 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  37.12 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  34.37 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.85 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  34.93 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.31 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.36 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.94 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.1 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  36.68 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.62 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.69 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 348 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.85 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  35.64 
 
 		 363 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  35.64 
 
 		 363 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  36 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  38.06 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  39.22 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.81 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.59 
 
 		 350 aa  236  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.81 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.28 
 
 		 340 aa  235  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.13 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.9 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.41 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.13 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.18 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.49 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.31 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.49 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.7 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.59 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.7 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.7 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  38.84 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.46 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.49 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.21 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  36.03 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.71 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.91 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.51 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  37.85 
 
 		 374 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.64 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.21 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.21 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.51 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.8 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.21 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.31 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.55 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.55 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.62 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.84 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.1 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.1 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.84 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.51 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.12 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.32 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.6 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>