More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0263 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  711    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  69.17 
 
 		 363 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.27 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  50.95 
 
 		 377 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  53.91 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.82 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  55.83 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.45 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  51 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.14 
 
 		 378 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.29 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.27 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  51.29 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.01 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.36 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  48.83 
 
 		 339 aa  321  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.84 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.73 
 
 		 360 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.16 
 
 		 353 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  51.42 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.22 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.06 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.63 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.13 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.74 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  48.14 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.53 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.03 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  44.54 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  47.67 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.7 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  45.35 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.97 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.63 
 
 		 363 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  49.71 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  47.89 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.89 
 
 		 375 aa  285  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.24 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.74 
 
 		 392 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  48.45 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  48.46 
 
 		 389 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  41.31 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.53 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.53 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 345 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  41.03 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.17 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 		 348 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.06 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.02 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  46.94 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.84 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.08 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.39 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  44.41 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.72 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  44.19 
 
 		 374 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.07 
 
 		 367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.77 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.04 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.71 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.16 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.77 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.64 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  41.16 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>