More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3359 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 396 aa  780    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  76.27 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  68.72 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.43 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  61.98 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  58.22 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.12 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.12 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.12 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.02 
 
 		 353 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.77 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.44 
 
 		 356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  58.06 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  59.08 
 
 		 376 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  60.41 
 
 		 375 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.81 
 
 		 357 aa  349  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.94 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  58.17 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  56.21 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  52.31 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  51.42 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.21 
 
 		 375 aa  323  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  53.16 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 348 aa  309  5.9999999999999995e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  54.6 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  54.52 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.86 
 
 		 356 aa  302  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.86 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 		 361 aa  299  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.7 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.31 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  54.62 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.16 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.51 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.78 
 
 		 385 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  50 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.44 
 
 		 349 aa  286  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  45.16 
 
 		 377 aa  285  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.38 
 
 		 348 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.57 
 
 		 336 aa  285  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.58 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  49.12 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.71 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.32 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.9 
 
 		 343 aa  282  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.86 
 
 		 363 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.39 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.18 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  51.59 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.43 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  48.18 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  54.97 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.73 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.09 
 
 		 392 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  44.9 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.25 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  48.35 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.68 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.19 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  43.96 
 
 		 384 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.88 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.28 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.28 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.72 
 
 		 367 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.74 
 
 		 392 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.01 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.88 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.02 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  46.37 
 
 		 374 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.61 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.88 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.54 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  45.61 
 
 		 356 aa  265  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.82 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.43 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.35 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  43.24 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.37 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.67 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.03 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.3 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>