More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0290 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 378 aa  749    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  57.22 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  57.03 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.5 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.07 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.87 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.77 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.49 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  51.79 
 
 		 355 aa  338  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  51.92 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.53 
 
 		 393 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 		 385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.33 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.73 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.92 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.65 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.48 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.75 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  49.59 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.4 
 
 		 392 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.12 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.12 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.12 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.06 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.78 
 
 		 344 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.74 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.65 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.64 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.2 
 
 		 348 aa  293  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.63 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.62 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.35 
 
 		 353 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.57 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  48.55 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  48.55 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  46.46 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.75 
 
 		 396 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.28 
 
 		 338 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  51.06 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  48.94 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.28 
 
 		 343 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  44.12 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.19 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.53 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.55 
 
 		 352 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  47.43 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  47.75 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.85 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.3 
 
 		 336 aa  262  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  48.18 
 
 		 361 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  43.01 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.51 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.28 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.34 
 
 		 357 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.95 
 
 		 352 aa  259  8e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.68 
 
 		 353 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.85 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.85 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.58 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 375 aa  253  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  48.11 
 
 		 355 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  44.95 
 
 		 355 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.72 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.08 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.25 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.99 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.07 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.46 
 
 		 340 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.64 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  43.75 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.85 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>