More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02171 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
392 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  69.82 
 
 
392 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.03 
 
 
393 aa  522  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.29 
 
 
393 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.96 
 
 
385 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.23 
 
 
385 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.84 
 
 
389 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.79 
 
 
389 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.48 
 
 
389 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.52 
 
 
389 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.79 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  47.59 
 
 
377 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 
377 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.6 
 
 
377 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  46.72 
 
 
375 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
377 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 
378 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 
378 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.86 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.86 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.86 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.75 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.28 
 
 
360 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 
355 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  46.5 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.82 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  44.56 
 
 
396 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.12 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
377 aa  269  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.33 
 
 
339 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 
353 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  43.79 
 
 
361 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  43.98 
 
 
370 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  51.54 
 
 
355 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 
354 aa  259  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 
349 aa  259  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  43.89 
 
 
361 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 
367 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 
356 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  42.7 
 
 
349 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.49 
 
 
344 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.53 
 
 
361 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 
356 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 
342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  43.27 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  43.68 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.17 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.36 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  44.79 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  42.08 
 
 
357 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  42.77 
 
 
348 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 
343 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.82 
 
 
357 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.34 
 
 
363 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 
364 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 
338 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 
364 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  41.9 
 
 
367 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.46 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.88 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  48.47 
 
 
366 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  40.24 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.28 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.52 
 
 
336 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  41.88 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  41.88 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.9 
 
 
363 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  40.43 
 
 
356 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.03 
 
 
363 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
375 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.3 
 
 
360 aa  240  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.29 
 
 
347 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
364 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  41.46 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.72 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 
339 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 
355 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.11 
 
 
351 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.11 
 
 
351 aa  239  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.49 
 
 
355 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  42.08 
 
 
367 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  43.06 
 
 
352 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 
340 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  42.31 
 
 
343 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 
340 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.16 
 
 
361 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.33 
 
 
352 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.43 
 
 
348 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.08 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  42.95 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.3 
 
 
364 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.9 
 
 
357 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  41.43 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.24 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  42.11 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.27 
 
 
340 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.46 
 
 
340 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.69 
 
 
336 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.65 
 
 
342 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>