More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3154 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.77 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.16 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.85 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.72 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.2 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.37 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.88 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49.72 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  45.92 
 
 		 377 aa  305  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  48.14 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.76 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  44.23 
 
 		 375 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  47.97 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.88 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.57 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.07 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 361 aa  279  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 343 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.23 
 
 		 357 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  44.93 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.91 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.21 
 
 		 360 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.44 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  44.31 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.08 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.09 
 
 		 344 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1055  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 369 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.24 
 
 		 349 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.57 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.98 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.44 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.96 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  43.15 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.49 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.8 
 
 		 363 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.8 
 
 		 363 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.71 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  44.87 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 358 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.8 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.97 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.12 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.99 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.13 
 
 		 340 aa  262  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  45.61 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.44 
 
 		 341 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.53 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.28 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.36 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.86 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.06 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.57 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.57 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.93 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  42.17 
 
 		 335 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.57 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.06 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  45.27 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.24 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.24 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07890  dihydroorotate oxidase A  44.86 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.68 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>