More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2362 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
377 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.31 
 
 
377 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.31 
 
 
377 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  61.52 
 
 
375 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  63.59 
 
 
377 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.89 
 
 
376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.99 
 
 
378 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.46 
 
 
378 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.45 
 
 
355 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49.44 
 
 
363 aa  332  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 
392 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.03 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 
356 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 
356 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 
356 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 
392 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  53 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.3 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  52.73 
 
 
349 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.79 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.09 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  53 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.43 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 
340 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.44 
 
 
357 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.06 
 
 
339 aa  300  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 
389 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  45.53 
 
 
360 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.89 
 
 
389 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 
343 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0201  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.06 
 
 
389 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.85 
 
 
356 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 
344 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 
342 aa  292  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.36 
 
 
361 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.92 
 
 
348 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.07 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 
361 aa  282  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 
338 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.48 
 
 
377 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 
338 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  41.85 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  46.03 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  46.03 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  44.29 
 
 
361 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.82 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  49.85 
 
 
375 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.58 
 
 
354 aa  272  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.31 
 
 
370 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  43.36 
 
 
361 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  47.32 
 
 
366 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.03 
 
 
350 aa  268  8e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  46.08 
 
 
396 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  42.46 
 
 
357 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  48.53 
 
 
355 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.63 
 
 
357 aa  262  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.06 
 
 
348 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.49 
 
 
363 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.15 
 
 
361 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.01 
 
 
375 aa  260  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  42.42 
 
 
352 aa  258  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.17 
 
 
355 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.66 
 
 
364 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.52 
 
 
356 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.64 
 
 
356 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.61 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  42.33 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.66 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.82 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  42.74 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 
356 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 
356 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  41.76 
 
 
376 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 
356 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.34 
 
 
345 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 
353 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.83 
 
 
344 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.62 
 
 
348 aa  249  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.46 
 
 
336 aa  249  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.06 
 
 
345 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.68 
 
 
336 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 
336 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 
336 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 
336 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  43.24 
 
 
364 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  41.74 
 
 
344 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.34 
 
 
355 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.72 
 
 
356 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.18 
 
 
337 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.98 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.34 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  41.53 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  41.98 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 
352 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.12 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.78 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.11 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  40.06 
 
 
348 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 
349 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>