More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2221 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 357 aa  715    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  86.36 
 
 		 356 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.64 
 
 		 375 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  62.12 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  63.76 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  58.81 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.26 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  62.06 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  59.77 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  59.94 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  56.7 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  55.43 
 
 		 367 aa  335  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  52.39 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.12 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.12 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.12 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.05 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  56.68 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  54.18 
 
 		 370 aa  301  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.02 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.33 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.14 
 
 		 349 aa  298  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.28 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  51.09 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.58 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  52.23 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  48.83 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.72 
 
 		 348 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  49.84 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.59 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.58 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.4 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  49.34 
 
 		 375 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 		 347 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.22 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.06 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.6 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.63 
 
 		 377 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  49.01 
 
 		 377 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.67 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.97 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  43.06 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.18 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.21 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.47 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.47 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  49.71 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.75 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.04 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.89 
 
 		 362 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.35 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.48 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.75 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.67 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.17 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.47 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.17 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  44.32 
 
 		 456 aa  255  8e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.18 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.52 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.7 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.6 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  41.52 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  41.52 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.52 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.52 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>