More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0222 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 362 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  92.82 
 
 		 362 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.9 
 
 		 362 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.31 
 
 		 363 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.52 
 
 		 364 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.52 
 
 		 364 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.52 
 
 		 364 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.43 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.34 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  58.31 
 
 		 348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.11 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.08 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.13 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.41 
 
 		 364 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.28 
 
 		 364 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.78 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.41 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  56.08 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.66 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.52 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.31 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.17 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.17 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.72 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.48 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.57 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  56.67 
 
 		 361 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.06 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 352 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.36 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.85 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.6 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.9 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.59 
 
 		 343 aa  302  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 357 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.37 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.95 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  48.6 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.24 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.16 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.85 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  48.94 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.52 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.95 
 
 		 336 aa  289  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  46.85 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.85 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.32 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  46.43 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.58 
 
 		 345 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 342 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 342 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.51 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.69 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.6 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.27 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.84 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.94 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>