More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_13090 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
384 aa  766    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  51.37 
 
 
348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.27 
 
 
367 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.32 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.75 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  49.31 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.3 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.19 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.19 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.35 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.91 
 
 
364 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.88 
 
 
354 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.73 
 
 
364 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 
358 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.73 
 
 
364 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.01 
 
 
358 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.24 
 
 
358 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.91 
 
 
364 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.6 
 
 
362 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.28 
 
 
362 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 
364 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.54 
 
 
355 aa  290  4e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 
352 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  45.74 
 
 
456 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.98 
 
 
363 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 
354 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.47 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04130  Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  45.16 
 
 
591 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 
363 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 
362 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55711  dihydroorotate dehydrogenase  44.3 
 
 
445 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.486902  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.27 
 
 
352 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 
354 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 
356 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  48.68 
 
 
339 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  47.75 
 
 
361 aa  279  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.61 
 
 
359 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  43.32 
 
 
357 aa  279  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.04 
 
 
343 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
362 aa  278  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.78 
 
 
340 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  44.8 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  44.8 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.4 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 
364 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.18 
 
 
370 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.01 
 
 
358 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 
350 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 
364 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.63 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.26 
 
 
363 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 
348 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
357 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 
350 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
348 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.29 
 
 
359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.03 
 
 
348 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 
359 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 
364 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.89 
 
 
344 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 
335 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.92 
 
 
339 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 
356 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 
356 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  44.23 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
360 aa  262  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  43.98 
 
 
361 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.73 
 
 
340 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.06 
 
 
336 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.55 
 
 
356 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.23 
 
 
361 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  44.28 
 
 
346 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.04 
 
 
342 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
345 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.29 
 
 
351 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.53 
 
 
339 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 
339 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 
339 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.65 
 
 
358 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 
361 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.48 
 
 
349 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.09 
 
 
344 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
339 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 
339 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 
339 aa  258  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 
331 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.73 
 
 
340 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 
353 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 
350 aa  257  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  42.13 
 
 
344 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.31 
 
 
341 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 
337 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 
352 aa  257  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>