More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04130 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04130  Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  100 
 
 		 591 aa  1185    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55711  dihydroorotate dehydrogenase  47.7 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.486902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  45.97 
 
 		 384 aa  286  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.95 
 
 		 364 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.19 
 
 		 364 aa  256  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.93 
 
 		 357 aa  256  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.3 
 
 		 364 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.03 
 
 		 364 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.25 
 
 		 364 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.61 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.19 
 
 		 364 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 363 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  40.43 
 
 		 339 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.99 
 
 		 344 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  39.51 
 
 		 374 aa  239  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  40.94 
 
 		 348 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.34 
 
 		 364 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.89 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 		 362 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.81 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.5 
 
 		 340 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.33 
 
 		 348 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 		 364 aa  228  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  39.73 
 
 		 456 aa  228  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 		 364 aa  228  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.75 
 
 		 357 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.04 
 
 		 362 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  39.22 
 
 		 346 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 348 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.56 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.05 
 
 		 362 aa  222  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.73 
 
 		 355 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 		 358 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  39.67 
 
 		 363 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.71 
 
 		 361 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.24 
 
 		 352 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.78 
 
 		 341 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.84 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.89 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.05 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.05 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.46 
 
 		 357 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  40.85 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  38.46 
 
 		 361 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.78 
 
 		 340 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.71 
 
 		 362 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.99 
 
 		 354 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.02 
 
 		 345 aa  218  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.06 
 
 		 341 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.78 
 
 		 369 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.61 
 
 		 348 aa  216  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  39.89 
 
 		 349 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 		 347 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 		 354 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.85 
 
 		 339 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.5 
 
 		 339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.4 
 
 		 341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  40.4 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.17 
 
 		 358 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 		 354 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.9 
 
 		 358 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 		 351 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.93 
 
 		 359 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.11 
 
 		 340 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.6 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 		 339 aa  213  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.25 
 
 		 350 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 353 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  39.95 
 
 		 356 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 353 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.32 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.32 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.29 
 
 		 340 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.74 
 
 		 351 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.74 
 
 		 351 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  39.16 
 
 		 348 aa  211  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.74 
 
 		 350 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  38.11 
 
 		 371 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.02 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.02 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.02 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.02 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.02 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.15 
 
 		 351 aa  210  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.56 
 
 		 337 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.99 
 
 		 339 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.99 
 
 		 339 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.32 
 
 		 345 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.09 
 
 		 357 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.91 
 
 		 336 aa  209  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.69 
 
 		 344 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.26 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.94 
 
 		 342 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.38 
 
 		 331 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  37.96 
 
 		 340 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.94 
 
 		 342 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.54 
 
 		 355 aa  207  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.06 
 
 		 344 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>