More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1958 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
356 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  86.36 
 
 
357 aa  623  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.79 
 
 
375 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  61.8 
 
 
366 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.26 
 
 
377 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  63.16 
 
 
376 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  59.38 
 
 
355 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  62.57 
 
 
361 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  58.87 
 
 
396 aa  349  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  57.46 
 
 
389 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  59.15 
 
 
355 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  53.37 
 
 
360 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  53.53 
 
 
367 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.57 
 
 
353 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.07 
 
 
356 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.07 
 
 
356 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.07 
 
 
356 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  55.81 
 
 
375 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.46 
 
 
353 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 
357 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  55.91 
 
 
370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  49.59 
 
 
348 aa  302  6.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 
361 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.14 
 
 
349 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 
340 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.16 
 
 
363 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  53.63 
 
 
342 aa  289  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 
344 aa  285  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  51.67 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 
348 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  48.25 
 
 
352 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  50.17 
 
 
355 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.71 
 
 
339 aa  278  9e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 
344 aa  275  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 
351 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  49.73 
 
 
354 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  50.49 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.17 
 
 
356 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.22 
 
 
342 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.07 
 
 
349 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.19 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.9 
 
 
348 aa  266  5.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
339 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
339 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.91 
 
 
336 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
339 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 
351 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.48 
 
 
354 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.36 
 
 
343 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  48.36 
 
 
377 aa  262  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 
331 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
393 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.18 
 
 
356 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 
349 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  43.57 
 
 
336 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 
339 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.33 
 
 
376 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 
365 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 
361 aa  258  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  42.62 
 
 
377 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.67 
 
 
393 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 
365 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.33 
 
 
339 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.06 
 
 
339 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 
378 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 
362 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 
351 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 
339 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 
364 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
339 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.62 
 
 
385 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.8 
 
 
347 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02751  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 
385 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.87 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.01 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.25 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.46 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 
339 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.91 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  50.29 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 
340 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.64 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.18 
 
 
347 aa  252  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.18 
 
 
347 aa  252  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
341 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  38.97 
 
 
336 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.48 
 
 
356 aa  250  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>