More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  100 
 
 		 367 aa  720    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.66 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.71 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.62 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  56.9 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.79 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  54.55 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  51.94 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  56.27 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  54.52 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  52.1 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1877  dihydroorotate dehydrogenase  55.37 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  54.24 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  54.55 
 
 		 376 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.19 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.04 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15520  dihydroorotate oxidase A  53.95 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  52.82 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.17 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  51.53 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.91 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  51.4 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  55.02 
 
 		 375 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.94 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.6 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.23 
 
 		 340 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.73 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  50.44 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  52.96 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.56 
 
 		 367 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.45 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.93 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.46 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  48.62 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  40.51 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 		 377 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.63 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.15 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  47.4 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.66 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.21 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.41 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.22 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 		 342 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.29 
 
 		 355 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.7 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 		 362 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.01 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  43.8 
 
 		 361 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.96 
 
 		 356 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  42.86 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.68 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 393 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.15 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.36 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.58 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.94 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.25 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27841  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.34 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.94 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.91 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.1 
 
 		 353 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.91 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.53 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  42.44 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.46 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.86 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  40.17 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.77 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  41.12 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.77 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.92 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.26 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.34 
 
 		 351 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>