More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5791 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
342 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.6 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.46 
 
 
356 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.26 
 
 
338 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  58.77 
 
 
361 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.37 
 
 
338 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.38 
 
 
355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  53.94 
 
 
363 aa  339  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  53.27 
 
 
355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 
376 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 
349 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.4 
 
 
348 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  47.49 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  47.38 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  48.44 
 
 
375 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 
378 aa  309  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 
344 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  50 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.84 
 
 
378 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.64 
 
 
344 aa  301  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  48.69 
 
 
336 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.27 
 
 
336 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  50.89 
 
 
352 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.87 
 
 
361 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 
361 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.83 
 
 
336 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.83 
 
 
336 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.83 
 
 
336 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 
343 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.5 
 
 
377 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 
377 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.5 
 
 
377 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
340 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 
336 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 
360 aa  288  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  48.22 
 
 
335 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
336 aa  288  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 
336 aa  287  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  46.75 
 
 
335 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 
336 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
336 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 
336 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.51 
 
 
340 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.25 
 
 
343 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 
339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.8 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.83 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.7 
 
 
351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.7 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 
337 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 
336 aa  282  7.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.96 
 
 
344 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 
339 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  50.15 
 
 
340 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 
336 aa  279  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  47.9 
 
 
343 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 
339 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
358 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 
335 aa  278  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 
339 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.52 
 
 
344 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 
357 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 
345 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 
345 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 
336 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.55 
 
 
347 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.72 
 
 
357 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.17 
 
 
360 aa  275  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  45.86 
 
 
336 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.83 
 
 
359 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 
340 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  49.11 
 
 
346 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.34 
 
 
348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.98 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.46 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.04 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.54 
 
 
385 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 
339 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.75 
 
 
356 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>