More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 354 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.6 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.2 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.43 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.94 
 
 		 338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.65 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  53.37 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  48.01 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49.71 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.5 
 
 		 376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.74 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.97 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  43.8 
 
 		 377 aa  292  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.45 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  45.25 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.16 
 
 		 336 aa  281  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.45 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.33 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.39 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 343 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.58 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  46.13 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.7 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.4 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.48 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.74 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.25 
 
 		 396 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.48 
 
 		 346 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.16 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.74 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.54 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.1 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.28 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.34 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.51 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  43.7 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.06 
 
 		 339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.93 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 337 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.09 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.16 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  48.41 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 		 342 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.93 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.61 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.61 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.61 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.61 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.61 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.61 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 		 339 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.4 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>